Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24DO94855 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms