Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPLO60437 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPLO60437 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPLO60437 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms