Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC28A2O43868 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms