Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLOCKO15516 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms