Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms