Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DGG1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms