Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WASHC1A8K0Z3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms