Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms