Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms