Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms