Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms