Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms