Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP11Q9Y3A2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms