Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms