Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SETD1BQ9UPS6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms