Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms