Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms