Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms