Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms