Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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