Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SH3BP4Q9P0V3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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SH3BP4Q9P0V3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP4Q9P0V3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP4Q9P0V3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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