Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms