Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THUMPD1Q9NXG2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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