Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms