Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms