Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX8Q9HC52 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX8Q9HC52 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms