Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms