Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms