Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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