Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM208Q9BTX3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms