Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms