Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms