Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms