Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms