Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342.1 ms