Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NELL2Q99435 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NELL2Q99435 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NELL2Q99435 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NELL2Q99435 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms