Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CTBP2-201ENST00000309035 3669 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms