Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms