Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms