Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms