Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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