Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BBOF1Q8ND07 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms