Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms