Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms