Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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