Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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