Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms