Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms