Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms