Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms